一位神秘人物的出现让小镇上的居民终日生活在恐惧之中，他利用一架邪恶的机器制造出了许多可怕的怪物，将它们放到镇上为非作歹。这时，就轮到“秘密公司”的诸位出马了，可摩拳擦掌跃跃欲试的沙吉（马修·里沃德 Matthew Lillard 饰）和搭档史酷比（Neil Fanning 配音）却被告知留守公司，不必参加行动。
阿基米德粒子加速实验室在设备没有进行试验的情况下，进行了粒子碰撞试验，从而导致实验室爆炸，参与试验的科学家们无一幸免。八年后，试验再次启动，结局会是什么？
