晶码战士》是一部大型科幻动画片连续剧，以“环保”为主题，围绕“历险”、“励志”展开，讲述了四位主人公与他们的晶码兽为了保护地球，与外星球邪恶集团作斗争的故事。
林家倚靠阳元矿石的买卖在炎城慢慢稳定了下来，然而一场突如其来的风波却又让他们损失惨重。林动虽然勉强掩护家人逃离，但是他深知只有自己能力真正的提升才能更好的保护家人。 妹妹青檀忍受寒毒折磨，为了不让哥哥林动担心，仍然表面保持着乐观，并对林动隐瞒寒毒的实情。
宇宙中的螺旋星系有颗美丽的星球——纳斯星球，星球上有一种神奇的果实，一直保护着整个纳斯星的生态平衡。 星球上的阿吉亚部落世世代代都守护着神之树，可是纳斯星上突然潜入了许多宇宙海盗，恰巧赛尔号上的先锋小队成员赛小息，阿铁打，卡璐璐途经此地，他们立刻加入了这场战斗…随着战况升级，四位神奇精灵：电系王...
宇宙海盗抓获了圣灵系神兽精灵迈尔斯，迈尔斯在被捕前将幻影宝石交给儿子蒙塔，将它送出了幻影星。 圣灵系迈尔斯的求救惊动了远在赫尔卡星的雷伊，雷伊迅速做出了反应前往了幻影星。 被海盗追击的蒙塔闯入赛尔号，并意外帮助赛小息赢得赛尔号一年一度的精灵大师杯的选拔赛。得知蒙塔的身世后，赛小息决定和队友阿铁...
