东京，这个多灾多难的城市，在公元2034年发生了一场大地震，结果彻底破坏了它。为了尽快复苏，基内姆跨国际企业使用了大量人造人：人们称呼它们为“亚人”；各种各样的亚人承担了几乎一切繁重的重建工作，所有对人类危险的工作也由他们来完成！时间，过去了6年，东京：昔日繁华的大都市，再一次在世人眼前矗立起来！...
1999年，由于数码世界资料异常增生，导致数码世界和现实世界的连接发生紊乱。地球上相应地出现奇怪的自然现象：东南亚没有下雨，池塘全部干涸；中东却因为连场大雨发生洪水；美国则遇到有史以来最寒冷的冬天。11岁的少年八神太一（藤田淑子配音），和伙伴石田大和（风间勇刀配音）、武之内空（水谷优子配音）、泉光...
